貴州省三都民族中學(xué)始建于1942年6月。

她的前身是三都造紙初級(jí)實(shí)用職業(yè)技術(shù)學(xué)校。

1948年更名為貴州省立三都中學(xué)。

1950年4月由三都縣人民政府接管改稱貴州省三都初級(jí)中學(xué)。

1958年9月貴州人民政府批準(zhǔn)建立完中，改稱貴州省三都民族中學(xué)。

1980年經(jīng)貴州省人民政府確認(rèn)為首批省屬24所重點(diǎn)中學(xué)之一，并正式改稱貴州省三都民族中學(xué)。

1942年籌建之初，開設(shè)初級(jí)造紙科一個(gè)班，招生對(duì)象是小學(xué)畢業(yè)生及同等學(xué)歷者，辦校經(jīng)費(fèi)由偽省政府財(cái)政開支。招收新生40人。與此同時(shí)，由偽縣政府財(cái)政開支，附設(shè)普通初中一個(gè)班，招收新生40人，全校共有學(xué)生80人（其中8人為女生）。初中班按普通中學(xué)學(xué)制開設(shè)課程，學(xué)生全部自費(fèi)入學(xué)。

1945年5月，第一屆兩個(gè)班的學(xué)生即將畢業(yè)，正遭遇都柳江的特大洪水，沿河民房受毀嚴(yán)重，原建于河邊的校舍全被沖毀，洪災(zāi)過后學(xué)校搬遷。

1949年11月1日中國人民解放軍挺進(jìn)大西南，11月24日三都縣解放。

1951年清匪剿敵已取得決定性勝利，黨和政府立即把三都中學(xué)復(fù)校問題提到議事日程，三都中學(xué)很快復(fù)校上課，當(dāng)時(shí)有初一、初二兩個(gè)班。

1952年在中共貴州省委領(lǐng)導(dǎo)下，對(duì)學(xué)校工作進(jìn)行調(diào)整，校名暫改為初級(jí)中學(xué)，縣長(zhǎng)于耀東兼任校長(zhǎng)，實(shí)行統(tǒng)一招生秋季開學(xué)。當(dāng)時(shí)全校共有三個(gè)班。

1958年，由于貫徹了“多、快、好、省”的辦學(xué)方針，強(qiáng)調(diào)普及中小學(xué)教育，初中班招新生六個(gè)班，高中招新生一個(gè)班，全校共十一個(gè)班。 [1] 

1986年起為結(jié)合少數(shù)民族地區(qū)特點(diǎn)發(fā)展教育，開辦以培養(yǎng)水族婦女人才為主要目標(biāo)的少數(shù)民族女子初中寄宿制班，當(dāng)年招生54人。

胡錦濤總書記任貴州省委書記期間，于1986年1月5日，親臨三都民族中學(xué)視察，勉勵(lì)廣大教師要發(fā)揮好民族中學(xué)自身優(yōu)勢(shì)，辦出自己的特色。 [2]  此后的省、州、縣各級(jí)領(lǐng)導(dǎo)也先后多次到學(xué)校視察和指導(dǎo)工作。

2001年被教育部列為寄宿制中學(xué)。

2010年被列為貴州省第一批普通高中新課程改革樣本校。期間歷經(jīng)兩次遷址、更名，最終發(fā)展成為省屬重點(diǎn)中學(xué)、省高中新課程改革樣本校，州創(chuàng)園林式學(xué)校。 [3] 

2015年8月已取消中學(xué)學(xué)制。